처음에는 쫄아서 개별 도메인 인증서를 여러 개 발급 받아서 했다. 막상 해보면 매우 쉬웠다. DNS 설정을 변경할 수 있는 권한이 있어야 한다.
sudo certbot certonly --manual --preferred-challenges dns -d "*.welovedoctor.com" -d "welovedoctor.com"
이렇게 인증서를 발급 받는다.

_acme-challange 라는 서브 도메인에 첫 번째 TXT 값을 입력한다. 그리고 엔터키 입력. 그러면 2번째 값을 또 입력하라고 한다. 방금 입력했던 곳에 가서 한 줄 바꾸고 따옴표로 또 입력해준다. 그러면 발급 성공.
NGINX 설정 파일에 가서 인증서 주소를 새로운 인증서 주소로 변경해 준다.
기존 인증서를 삭제하려면 /etc/letsencrypt/live에 가서 인증서 파일을 삭제한다.
기존 인증서 갱신 과정을 없애려면 /etc/letsencrypt/renewal 홈페이지에 가서 해당 인증서에 관한 파일을 모두 삭제한다.