오늘 아침에 slide conference 를 하다가 lower GI tract 의 NET는 chromogranin A 가 잘 나오지 않는 현상에 대한 언급이 있었다. 왜 그렇게 되는지에 대한 언급은 없으나 foregut 및 midgut 에 비하여 hindgut 에 발생하는 NET는 chromogranin A 및 CD56 발현이 잘 보이지 않는다는 언급이 있는 review article 을 찾을 수 있었다. [1] 위치에 따라서 주로 분비하는 molecules 이 다르기 때문일 것으로 추정됨.
INI1 과 관련된 질병군도 조만간 생길 것 같음 [1]
a = “ATGAATAAGGGCTG…GCGCCAGTGA”
b = strsplit(a, “\n”)
for (X in 1:length(b[[1]])){
if (X == 1) X1 = b[[1]][X]
if (X >= 2) X1 = paste(X1, b[[1]][X], sep=””)
}
substr(X1, 1770, 1780)
CCDS 에서 찾고자 하는 유전자의 coding sequence 를 확보한 후에, 특정 위치의 아미노산이 어디쯤 있는지 찾아보는 편한 방법을 생각해 보았다.
새로 이직하는 곳은 인터넷 보안이 꽤 빡빡하다. 교육 때 리눅스 컴퓨터 사용에 대한 문의를 하였다.
이런 2가지 옵션이 있었고, 2번의 방법을 사용하기로 하였다. linux 에 추가 네트웍 카드 설치에 대한 제한점은 없는 것으로 판단하였다. 그래서 별도의 mirror 서버를 구축하여 일정 주기로 업데이트 하는 방법을 선택하는 것이 좋을 것 같았다. 구글링과 [1] CRAN 공식 홈페이지 [2] 를 통하여 미러 서버를 구축중에 있다.
http://freesearch.pe.kr/archives/3913