문자 조합으로 R의 명령어를 만든 다음 그 것을 실행하고자 할 경우에는 다음과 같이 명령어를 실행하면 된다.
paste 안에 잘 만들어서 넣으면 똑같이 실행됨.
” 기호가 필요한 경우라면 “\”” 와 같은 식으로 별도의 문자로 인식되도록 할 수 있음.
eval(parse(text=paste(……..)))
Blog
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SNU Gastric cancer cell lines
언젠가는 가볍게 읽어 보아야 할 그런 논문.
Reference: Park JG, Yang HK, Kim WH, Chung JK, Kang MS, Lee JH, et al. Establishment and characterization of human gastric carcinoma cell lines. Int J Cancer. 1997;70(4):443-9.
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Forest plot
(그림 파일은 영문 wikipedia 에서 사용된 것임) meta 연구에서 주로 사용된다고 알려진 forest plot.
그런데 이 plot 은 다변량 분석을 시행한 연구에서도 쓰는 것을 보았다. 통계 분석에 사용된 각종 통계 인자들을 정리하는 것도 table 하나를 차지하니까, 그것을 이렇게 plot 으로 그려도 좋겠다는 생각이 든다.
heatmap 을 사용한 논문을 시도하겠다는 처음의 시도는 성공했으니까,
다음의 목표는 바로 이 forest plot 이다.
Satoh T, Xu RH, Chung HC, Sun GP, Doi T, Xu JM, et al. Lapatinib Plus Paclitaxel Versus Paclitaxel Alone in the Second-Line Treatment of HER2-Amplified Advanced Gastric Cancer in Asian Populations: TyTAN-A Randomized, Phase III Study. J Clin Oncol. 2014;32(19):2039-49. -
여자 위암
위암 연구에 있어서 남자와 여자로 구분만 해도 상당한 효과의 차이가 난다는 내용임. 그 동안 성별을 하나의 factor 로 여겨서 통계 분석을 시도하였는데, 성별을 따로 분류해서 통계를 실행해도 될지도 모른다는 느낌.
Reference: Wang L, Jiao Y, Jiao Y, Cao Y, Gu W. Gastric cancer drug trials-are women second class citizens? Nat Rev Clin Oncol. 2014;11(7):438.