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sshpass
ssh 접속을 해야할 경우 비밀번호를 입력하지 않기 위해서는 key를 만들어서 이용하는 것이 원칙이다. 하지만 이 방법을 이용할 수 없을 경우 sshpass를 이용하면 할 수 있다.
```
sshpass -p PASSWORD ssh -p 20534 byun1114@synology.work
```
이렇게 하면 된다.
2023-08-11
TrueNAS HDD 교체

작년에 TrueNAS HDD를 교체하였는데 별 다른 기록을 남겨두지 않아서 이번 기회에 다시 기록해 본다.

Storage / Pools / Status로 들어간다.

이번 경우에는 ada1을 교체해야 했다. 그래서 이 것을 offline으로 변경하여 준다. 그리고 시스템 종료 후 HDD를 교체하고 다시 부팅한다.

Replace를 해주면 교체 작업 (resilvering) 이 자동으로 진행된다.

2023-07-25
HU로 변환하기
DICOM 이미지의 값을 HU로 변환하는 방법.

How convert CT Dicom Files to HU(positive values)?
I’m working on DICOM files(CT files).I want to use Rescaleslope and Rescaleintercept for converting my data to HU with relation: X_IMAGE(:,:,path.ImageIndex) = (dicomread(path))*path.RescaleSlope…
```
import pydicom
dicom = pydicom.dcmread(filepath)
dicom_hu = dicom.pixel_array * dicom.RescaleSlope + dicom.RescaleIntercept
```
CT의 경우 slope 이 1이고 intercept 가 -1024이다. 즉, 수직 이동만 하는 것이다. 하지만 이렇게 변환해서 하는게 훨씬 더 academic 한 것 같다.
2023-07-21
numpy 3d array, matplotlib
2d array라면 matplotlib에서 plot이 잘 그려진다. 그런데 3d array라면 오류가 발생한다. 1차원 값으로 분리해줘야 한다. 여러 방법을 시도해 봤는데 numpy.nonzero를 이용한 방법이 간결하게 먹힌다. 색상 정보는 나에게 중요한게 아니라서 이 방법이 좋았다.

Creating a 3D plot from a 3D numpy array
Ok, so I feel like there should be an easy way to create a 3-dimensional scatter plot using matplotlib. I have a 3D numpy array (dset) with 0’s where I don’t want a point and 1’s where I do, basica…
```
dcm_x,dcm_y,dcm_z = blk.nonzero()
dcm_color = numpy.random.rand(len(dcm_x))

fig = plt.figure(figsize=(10, 10))

ax = fig.add_subplot(projection='3d')
ax.set_zlim3d(-600, 0)
ax.view_init(30, 145)
ax.scatter(dcm_x,dcm_y,-dcm_z,c=dcm_color)
plt.savefig("/root/" + i +".png")
```
2023-07-20