WeLoveDoctor

Category: 03_Study

  • 쳇쳇쳇..

      FFPE에서 RNA를 추출해서 검사를 진행하는 과정을 알아보기 위해서 틈틈히 자료를 찾아보고 있었는데 오늘 그럴듯한 글을 하나 찾았다. 다음주는 알코올에서 벗어날 수 없을텐데… 천천히 읽어보아야 겠다. ㅡㅡ;;

  • 2008-12-11

    공부하거나 찾아볼 내용

    1. RNA 추출 후 측정하는 RIN 값이란?

    Schroeder A, Mueller O, Stocker S, et al. The RIN: an RNA integrity number for assigning integrity values to RNA measurements. BMC Mol Biol 2006; 7: 3.

    2. Quality Control 을 위한 Primer 의 sequence 와 Primer를 제작하거나 구할 수 있는 곳.

    3. 사용할 수 있는 PCR 장비?

    가능하면 Roche에서 나온 LifeCycler 제품으로…

  • RNA and FFPE

      파파핀 블럭 그러니깐 흔히 FFPE 라고 말하는 조직에서 RNA를 추출하게 된 지는 그렇게 오래 지나지 않았다. 그거는 별로 중요하지 않고 아무튼 Study를 계속 진행하기 위해서는 이 FFPE에서 RNA를 추출해야 하는데 일반적인 Protocol 로 할 경우 왠만하면 잘 된다는 연구가 있었다. 아무리 안나오더라도 3번 정도 시도하면 나온다는 그런 내용도 있었다.

    All protocols extracted RNA from ten year old FFPE samples with a minimum RIN of 1.4. Gene expression of G6PD could be measured in all samples, old and recent, using RT-PCR primers designed for RNA fragments up to 151 bp.
    (Reference: Ribeiro-Silva A, Zhang H, Jeffrey SS. RNA extraction from ten year old formalin-fixed paraffin-embedded breast cancer samples: a comparison of column purification and magnetic bead-based technologies. BMC Mol Biol 2007; 8: 118.)

      이제 다음 단계는 추출이 잘 되었는지 평가를 하기 위한 RT-PCR 과정이다. ㅡ_ㅡ;; 다시 공부하기 시작해야지.

  • Prostate 12 core biopsy

      굳이 외울 필요까지는 없지만 알아두면 요긴한 그림. 육안 검사할 때 같이 생검 결과와 같이 보면서 하면 쬐끔 도움이 되기는 한다. 하지만 전립선 조직은 다 슬라이드를 만들어버리기 때문에 ㅡㅡ;;

    Reference: Philip J, Ragavan N, Desouza J, Foster CS, Javle P. Effect of peripheral biopsies in maximising early prostate cancer detection in 8-, 10- or 12-core biopsy regimens. BJU Int 2004; 93: 1218-20.