Category: 03_Study

  • A deep learning approach to automate refinement of somatic variant calling from cancer sequencing data1

    이 논문은 초록도 제대로 읽어보지 않았다. 조금 후의 미래에서는 variant calling 과정에 deep learning으로 개발된 알고리즘을 적용할 수 있을 것이라고 생각된다.

    1.
    Ainscough B, Barnell E, Ronning P, et al. A deep learning approach to automate refinement of somatic variant calling from cancer sequencing data. Nat Genet. November 2018. [PubMed]
  • The importance of indifference in scientific research1

    Every project has discrepancies, you can’t follow every one or you will never  publish. But some of them are crucial; if you ignore them you will miss  something big. The way we make these choices accounts for a significant part  of what distinguishes the good scientists from the great ones.

    1.
    Schwartz M. The importance of indifference in scientific research. J Cell Sci. 2015;128(15):2745-2746. [PubMed]
  • Impact of Deep Learning Assistance on the Histopathologic Review of Lymph Nodes for Metastatic Breast Cance

    Impact of Deep Learning Assistance on the Histopathologic Review of Lymph Nodes for Metastatic Breast Cancer1

    올해 AACR에서 발표된 구글의 병리 딥러닝 발표 중에서 유방암에 관련된 내용이 AJSP에 논문으로 발표 되었다. 컴퓨터 보조 시스템이 sentinel LN의 ITC나 micrometastasis 발견에 용이할 것이라는 건 이런 논문을 통하지 않고서도 충분히 예상 가능한 부분이다. 다만, 조금 더 현실적인 측면에서 바라보면 병리 의사는 스캔 이미지를 분석하는 것이 아니라, slide holder에 슬라이드를 올려놓고 x10 대물렌즈를 이용한 결과를 분석한 것이 더 좋지 않았을 까 싶다. 스캔 이미지 파일을 뷰어로 보는 것은 현미경에서 직접 보는 것보다 같은 배율이더라도 굉장히 불편하다.

    1.
    Steiner D, MacDonald R, Liu Y, et al. Impact of Deep Learning Assistance on the Histopathologic Review of Lymph Nodes for Metastatic Breast Cancer. Am J Surg Pathol. 2018;42(12):1636-1646. [PubMed]
  • Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 Testing in Breast Cancer American Society of Clinical Oncology/College of American Pathologists
    Clinical Practice Guideline Focused Update1

    1.
    Wolff A, Hammond M, Allison K, et al. Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 Testing in Breast Cancer: American Society of Clinical Oncology/College of American Pathologists Clinical Practice Guideline Focused Update. Arch Pathol Lab Med. 2018;142(11):1364-1382. [PubMed]