meta 연구에서 주로 사용된다고 알려진 forest plot.
그런데 이 plot 은 다변량 분석을 시행한 연구에서도 쓰는 것을 보았다. 통계 분석에 사용된 각종 통계 인자들을 정리하는 것도 table 하나를 차지하니까, 그것을 이렇게 plot 으로 그려도 좋겠다는 생각이 든다.
heatmap 을 사용한 논문을 시도하겠다는 처음의 시도는 성공했으니까,
다음의 목표는 바로 이 forest plot 이다.
meta 연구에서 주로 사용된다고 알려진 forest plot.
그런데 이 plot 은 다변량 분석을 시행한 연구에서도 쓰는 것을 보았다. 통계 분석에 사용된 각종 통계 인자들을 정리하는 것도 table 하나를 차지하니까, 그것을 이렇게 plot 으로 그려도 좋겠다는 생각이 든다.
heatmap 을 사용한 논문을 시도하겠다는 처음의 시도는 성공했으니까,
다음의 목표는 바로 이 forest plot 이다.
위암 연구에 있어서 남자와 여자로 구분만 해도 상당한 효과의 차이가 난다는 내용임. 그 동안 성별을 하나의 factor 로 여겨서 통계 분석을 시도하였는데, 성별을 따로 분류해서 통계를 실행해도 될지도 모른다는 느낌.
Reference: Wang L, Jiao Y, Jiao Y, Cao Y, Gu W. Gastric cancer drug trials-are women second class citizens? Nat Rev Clin Oncol. 2014;11(7):438.
여러 논문을 찾아본 결과, 2007년 Punt 의 논문이 대장암 연구에서 사용되는 각종 survival time 에 대한 정의를 내려놓은 것을 찾을 수 있었다. 이 방식을 다른 암종에도 적용할 수 있는 것은 아니겠지만, 참고할 수는 있으니 꼭 알아두어야 할 논문이라고 할 수 있을 듯 하다. 이 외에 유방암에 대하여 정의해둔 논문이 있기는 한데(J Clin Oncol. 2007;25(15):2127-32.), 이 논문은 내가 쓸 일은 없을 듯 하니 이 번에는 생략함.
DFS의 경우 좀 유의할 만한 점은 다른 암이 생겼거나 다른 이유로 죽어도 모두 event 로 정의한 다는 것이다. 상당히 의외의 부분이었음. 생존 분석을 할 때에 굉장히 구체적으로 자료를 미리 정해두는 것의 필요성을 알게 해주었음.
Reference: Punt CJ, Buyse M, Kohne CH, Hohenberger P, Labianca R, Schmoll HJ, et al. Endpoints in adjuvant treatment trials: a systematic review of the literature in colon cancer and proposed definitions for future trials. J Natl Cancer Inst. 2007;99(13):998-1003.
소아 뇌종양 자체가 워낙 드문 종양이기는 한데, 그 중에서도 IF가 높은 논문에 가장 자주 보이는 종양은 Medulloblastoma 이다. 이 논문은 GLI2, MYC, chr 11, chr 14, 17p, 17q에 대한 FISH 검사를 통한 상태 확인을 통하여 소그룹(subgroup)에서 예후 인자의 유용성을 밝힌 논문이라고 하고 있다. 전세계에서 환자 증례를 모아서 시도한 연구이니 만큼 당분간 이보다 큰 규모의 환자군을 대상으로 한 연구는 쉽게 시도되지 못할 것은 당연한 사실.
Subgroup 을 나누는 방식은 쉽게 할 수 있는 H&E 염색이나 IHC 방식이 아닌 분자검사학적인 방법을 통한 것이 아쉬울 따름. Macroscopic metastasis 같이 뻔히 나쁜 예후인자 일 것 같은 경우도 포함해서 위험도 분석을 했다는 것이 아쉬울 따름. iso17q 같은건 interphase FISH 에서 어떻게 보일지도 궁금함.