Category: Python

blank mp3 만들기
Bing 에 물어봤더니 친절히 다음 코드를 알려 주었다. 아쉬운 점은 ffmpeg 가 설치된 환경에서 정상적으로 동작한다는 것을 알려주지는 않았다.
```
from pydub import AudioSegment

# create 1 second of blank audio
blank = AudioSegment.silent(duration=1000)

# export the blank audio as an mp3 file
blank.export("blank.mp3", format="mp3")
```
2024-01-04
HU로 변환하기
DICOM 이미지의 값을 HU로 변환하는 방법.

How convert CT Dicom Files to HU(positive values)?
I’m working on DICOM files(CT files).I want to use Rescaleslope and Rescaleintercept for converting my data to HU with relation: X_IMAGE(:,:,path.ImageIndex) = (dicomread(path))*path.RescaleSlope…
```
import pydicom
dicom = pydicom.dcmread(filepath)
dicom_hu = dicom.pixel_array * dicom.RescaleSlope + dicom.RescaleIntercept
```
CT의 경우 slope 이 1이고 intercept 가 -1024이다. 즉, 수직 이동만 하는 것이다. 하지만 이렇게 변환해서 하는게 훨씬 더 academic 한 것 같다.
2023-07-21
numpy 3d array, matplotlib
2d array라면 matplotlib에서 plot이 잘 그려진다. 그런데 3d array라면 오류가 발생한다. 1차원 값으로 분리해줘야 한다. 여러 방법을 시도해 봤는데 numpy.nonzero를 이용한 방법이 간결하게 먹힌다. 색상 정보는 나에게 중요한게 아니라서 이 방법이 좋았다.

Creating a 3D plot from a 3D numpy array
Ok, so I feel like there should be an easy way to create a 3-dimensional scatter plot using matplotlib. I have a 3D numpy array (dset) with 0’s where I don’t want a point and 1’s where I do, basica…
```
dcm_x,dcm_y,dcm_z = blk.nonzero()
dcm_color = numpy.random.rand(len(dcm_x))

fig = plt.figure(figsize=(10, 10))

ax = fig.add_subplot(projection='3d')
ax.set_zlim3d(-600, 0)
ax.view_init(30, 145)
ax.scatter(dcm_x,dcm_y,-dcm_z,c=dcm_color)
plt.savefig("/root/" + i +".png")
```
2023-07-20
Jupyter 에서 bash 기본 사용하기
Jupyter에서 terminal을 실행시키면 기본적으로 sh을 사용한다. 이것을 bash로 바꾸어 본다.

~/.jupyter/jupyter_lab_config.py 파일에서 다음의 내용을 추가한다.
```
c.ServerApp.terminado_settings = {'shell_command': ['/bin/bash']}
```
How can the terminal in Jupyter automatically run bash instead of sh
I love the terminal feature and works very well for our use case where I would like students to do some work directly from a terminal so they experience that environment. The shell that launches
2023-05-25