Author: byun1114

  • Patterns of somatic structural variation in human cancer genomes

    chromsome structure 변이에 대한 논문. 진단 방법이 현저히 어렵다는게 문제…

    https://doi.org/10.1038/s41586-019-1913-9

  • NHIS 표본코호트 v1

    건보공단에 문의했더니 표본코호트 v1은 폐기된 자료라고 함. 그래서 자료를 좀 공개해 보겠음. 어떻게 구한 이 자료는 모든 자료가 있는 것은 아니었음. DB에 넣을려고 하는 과정에서 data cleaning 과정이 필요했고, 그 부분을 기술해 보고자 함. 나는 R에서 TSV 자료를 불러와서 data cleaning 을 한 다음 CSV로 저장해서 DB에서 PSQL을 통하여 저장하였음.

    • R에서 파일을 불러올 때에 , fileEncoding = “CP949”, encoding = “UTF-8” 부분이 필요함. 일부 자료에서 원래는 포함되면 안되는 한글이 있음
    • 20 테이블에서 MPRSC_ISSUE_ADMIN_ID, MPRSC_GRANT_NO 항목이 없는 경우가 있기 때문에, 추가해 주어야 함.
    • 20 테이블에서 DMD_DRG_NO, SUB_SICK, MAIN_SICK에 특수문자를 비롯한 부적절한 값들이 있음.
    • 비용과 관계된 부분은 자리수가 8이 아닌 9로 해야함.
  • Using Time Dependent Covariates and Time Dependent Coeffcients in the Cox Model

    time-dependent Cox 돌릴 일이 있을 때 참고할 것. 위의 제목으로 구글 검색하면 관련 문서를 찾을 수 있음.

  • Nerves in cancer

    나중에 필요한 일 있을까봐 링크.

    https://doi.org/10.1038/s41568-019-0237-2