Category: Study

  • MDM2

    MDM2

    저자들이 사용한 기준은

    200개의 세포를 평가함. 15% 이상에서 amplification (15 MDM2 signals / cells) 을 보일 때를 양성이라고 판독했음.

    Lipomatous tumor 에서 200개의 세포를 그것도 FISH 로 보다니 대단한다. FISH 사진은 없는데.. Weiss 씨가 참여해서 그런건가..

    Reference: Clay, M.R., et al., MDM2 Amplification in Problematic Lipomatous Tumors: Analysis of FISH Testing Criteria. Am J Surg Pathol, 2015.

  • Optimal Patient Selection for Trastuzumab Treatment in HER2-Positive Advanced Gastric Cancer

    Optimal Patient Selection for Trastuzumab Treatment in HER2-Positive Advanced Gastric Cancer

    위암에서도 HER2 증폭 정도에 따라서 반응이 다를 것이다라는 논문이 나오기는 했다. IHC3+ 의 중요성과 더불어 HER2/CEP17 ratio 도 중요한 요소가 되는 세상이다.

    Reference: Ock, C.Y., et al., Optimal Patient Selection for Trastuzumab Treatment in HER2-Positive Advanced Gastric Cancer. Clin Cancer Res, 2015. 21(11): p. 2520-9.

  • TCGA Barcode

    TCGA Barcode

    TCGA 자료 바코드가 어떤 규칙에 의하여 명명되었는지에 대한 내용.

    Code    Definition     Short Letter Code
    01      Primary solid Tumor    TP
    02      Recurrent Solid Tumor  TR
    03      Primary Blood Derived Cancer –
    Peripheral Blood      TB
    04      Recurrent Blood Derived Cancer –
    Bone Marrow TRBM
    05      Additional – New Primary      TAP
    06      Metastatic     TM
    07      Additional Metastatic  TAM
    08      Human Tumor Original Cells    THOC
    09      Primary Blood Derived Cancer –
    Bone Marrow   TBM
    10      Blood Derived Normal   NB
    11      Solid Tissue Normal    NT
    12      Buccal Cell Normal     NBC
    13      EBV Immortalized Normal       NEBV
    14      Bone Marrow Normal     NBM
    20      Control Analyte CELLC
    40      Recurrent Blood Derived Cancer –
    Peripheral Blood    TRB
    50      Cell Lines     CELL
    60      Primary Xenograft Tissue      XP
    61      Cell Line Derived Xenograft Tissue    XCL
     

  • Groove pancreatitis

    Groove pancreatitis

     

    DeSouza, K. and L. Nodit, Groove pancreatitis: a brief review of a diagnostic challenge. Arch Pathol Lab Med, 2015. 139(3): p. 417-21.

    정말 처음 듣는 질환명.

    췌장의 두부, 십이지장, CBD 사이에 해당하는 췌장의 groove 지역에 호발하는 만성 췌장염의 하나. 주로 minor papilla 를 침범한다고 함.