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Author: byun1114

  • The rediscovery of platinum-based cancer therapy

    백금계열 항암제의 기전 및 세포 내 동작 매커니즘을 알려주는데에서 유용성이 있다고 생각한다.

    https://doi.org/10.1038/s41568-020-00308-y

  • 티마이오스, 플라톤, 박종현/김영균 공동 역주, 서광사

    지난 번에 보았던 플라톤의 국가에 이은 책이다. 내가 읽은 순서가 그렇기도 하지만, 실제로 국가의 논의에서 이어지고 있다. 그런데 대부분은 좀 뜬금없는 소리를 하고 있다. 아틀란티스 대륙이라던가, 체액을 이루는 4가지라던가, 신체의 구성, 우주 별의 움직임, 삼각형 등등등 이런 소리가 90% 이상은 된다. 수학능력시험이나 플라톤 철학에 대하여 깊이 알아야 하는 사람들에게는 유용한 내용이 있을 것이나, 그렇지 않다면 뜬금없는 소리로 책의 대부분을 때우는 영양가 없는 책으로 받아들여 질 수 있다. 하지만, 플라톤 선생님께서 딱 한 구절 정도는 가치있는 문장을 적어두셨다.

    그리고, 이것들이 혼의 세 군데 거처로 옮겨가게 되면, 그것들 각각이 침입하는 곳에 따라 온갖 불만과 낙담을 생기게 하는가 하면, 갖가지의 만용과 비겁, 더 나아가 망각과 더딘 배움을 다채롭게 생기게 합니다. 이에 더하여, 이처럼 나쁘게 굳어 버린 사람들의 정치 체제들이 나쁘고, 논의들 또한 이들 나라에 맞게 사사롭게도 공적으로는 하게되며, 더 나아가 이것들을 치유해 주는 학문들도 어떤 식으로건 어린 시절부터 배우지 못할 경우에, 모든 사람이 나쁘게 되는 것이 이처럼 이 두가지 것으로 인해서이니, 이것들은 자의와는 전혀 상관이 없습니다. 이 모든 탓을 자식들보다는 낳은 쪽에 그리고 양육되는 쪽보다는 양육하는 쪽에 언제나 돌려야 합니다. 그렇지만 사람이 할 수 있는 대로, 양육과 종사하는 일들과 학문들을 통해 나쁨은 피하되, 그 반대의 것은 취하도록 노력해야 합니다.

  • 일정한 패턴을 가진 항목 찾기

    쉽게 말하면 ‘> 125 (150)’ 이런 식으로 구성되어 있는 것을 찾는 것이다. 

    WHERE 변수 LIKE '%>%(%)%'

    저런 형식으로 입력해서 찾으면 된다.

    그 중에서 괄호 안의 값을 찾는 방법이 필요했다. 내가 시도한 방법은 ‘(‘를 기준으로 문자열을 분리 후 2번째 항목을 선택한다. 그럼 ‘150)’ 형식으로 된다. 그 다음에는 ‘)’을 ”으로 REPLACE 시켜준다. 

    REPLACE(split_part(변수, '(', 2), ')', '')

    일부가 3.56E-1 이런 형식을 하고 있었다. 불행 중 다행이라면 여백이 없었다는 것이다. 다음과 같이 실수형태로 변환시켰다.

    CAST(SPLIT_PART(변수, 'E', 1) AS NUMERIC)*10^CAST(SPLIT_PART(변수, 'E', 2)

    127.7. 과 같은 형식도 있었다. PostgreSQL에서는 뒤쪽에서 부터 단어를 선택하는 함수는 없는 것 같다. 하지만, 뒤집는 것은 있다. 일단 해당 값에서 ‘.’이 2개가 있는 것을 확인하는 것이 필요하다. 전체 길이에서 찾고자 하는 글자를 삭제한 후 글자 길이가 2개만큼 줄어드는 것을 찾으면 된다.

    WHERE (LENGTH(변수)-LENGTH(REPLACE(변수, '.', ''))) = 2

    ‘.’이 2개인 것을 찾았으면 뒤집는다. 그럼 ‘.7.721’이다. 2번째 글자부터 끝까지 단어를 선택한 다음 다시 뒤집으면 된다.

    REVERSE(SUBSTR(REVERSE(변수), 2, CHAR_LENGTH(변수)))

    여백을 없애야 했다. 여백은 TRIM으로 없애는 것이 기본이나 별의 별 형식으로 공간을 잡아먹는 녀석들이 있다. 따라서 정규식이나 escape 문자를 이용한다.

    REGEXP_REPLACE(변수, '\s+', '')

    이것은 정규식 형태이다. 빈 줄은 다음과 같은 식으로 제거한다.

    REGEXP_REPLACE(변수, E'[\n\r]+', '')

    이렇게 실수형태가 아닌 것들을 다 제외시킨다. 나의 경우에는 이제 실수형태가 아닌 것들만 남아 있었다. 이를 확인하는 것은 매우 어려웠다. 이 정규식을 인터넷에 공개해주신 분(http://mwultong.blogspot.com/2006/09/regex-signed-float.html)께 대단히 감사. 추가로 자료를 찾아본 결과 정규식 표현에서 ~는 like 의미로 쓰인다고 한다. 그렇다고 like를 쓰면 동작하지는 않는다.

    WHERE 변수 ~ '^[+-]?\d*(\.?\d*)$'

    이렇게 하면 실수 형태인 자료들을 찾을 수 있다. 그런데 이런 값들은 정리해줄 필요가 없다.

    select regexp_replace(변수, '^\D+', '') from ... 
  where 변수 ~ '^\D+[+-]?\d*(\.?\d*)$';

    이렇게 하면 변수에 실수 앞 부분에 숫자 이외의 문자가 하나 이상 포함되어 있고 그 뒷 부분은 실수형태인 것들을 찾을 수 있다. 대표적이라면 > 10 같은 것이다. 이러면 실수형태 앞부분을 삭제할 수 있다.

    select regexp_replace(변수, '\D+$', '') from ... 
  where 변수 ~ '^[+-]?\d*(\.?\d*)\D+$';

    이러면 실수형태 숫자 뒤쪽에 문자가 있는 것들을 삭제할 수 있다. ’20 이하’ 같은 것 말이다.

    • 여기까지 해보니 다음과 같은 순서대로 하면 될 것 같다. >100(125) 같은 형태의 자료는 우선적으로 처리해 준다.
    • 쉼표를 제거한다.
    • ‘..’을 처리한다.
    • 공백과 빈 줄을 제거한다.
    • 빈 칸이 입력된 것은 NULL로 바꾸어 준다.
    • 앞에 숫자 아닌 거 들어간 것을 없애주고, 뒤에 숫자 아닌거 들어간 것을 없애준다.
    • 실수 형태가 아닌 자료들을 확인해서 NULL로 바꾼다.
    UPDATE .. SET 변수 = REGEXP_REPLACE(변수, '^\D+', '') ;
UPDATE .. SET 변수 = REGEXP_REPLACE(변수, '\D+$', '') ;

  • Database 복사하기

    떨어진 컴퓨터로 DB를 복사하는 방법은 pg_dump이지만, 같인 PC에서 복사할 때에는 명령어로 만들 수 있다.

    CREATE DATABASE targetdb WITH TEMPLATE sourcedb;