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Author: byun1114

  • 육아는 과학이다

    육아는 과학이다

    육아도 과학이 필요한 부분이라는 것은 인정함. 그런데 이 책은 지나치게 뇌신경 분야의 내용을 언급하고 있음. 조금 심함. 왠만한 것은 다 호르몬과 관련되어 있음. 나와는 코드가 꽤 안맞음.

  • 베이비 토크

    베이비 토크

    3~9개월 항목만 좀 읽어 보았다. 이야기 하는 방법이 조금 어렵다. -_-;; 다시 빌려서 볼 것인지.. 아니면, 그저 하던 대로 할 것인지 고민.

  • CoxPH 와 model selection

    CoxPH 와 model selection

    없을리가 없다고 생각했지만 그 동안 R에서 못썼던 기능 중 하나는 Cox PH 분석에서 forward 혹은 backward 방식의 model selection 이다. 너무 쉽게 찾아낸 방법은 step() 함수이다.

    step() 괄호 안에 coxph 명령어를 넣고 실행하면 SPSS 랑 똑같이 나온다. 다만, forward 순서는 조금 다르게 나오는 듯함. 내가 잘못 사용하고 있는지도 모르겠다.

    SPSS 에서는 결측값이 있는 항목이 들어갈 경우 자동으로 그 부분을 인식하지만, R에서는 에러가 나기 때문에 결측값이 없는 자료만을 입력해야 한다.

    trace=0 을 사용하면 최종 결과만을 확인할 수 있다.

  • MDM2

    MDM2

    저자들이 사용한 기준은

    200개의 세포를 평가함. 15% 이상에서 amplification (15 MDM2 signals / cells) 을 보일 때를 양성이라고 판독했음.

    Lipomatous tumor 에서 200개의 세포를 그것도 FISH 로 보다니 대단한다. FISH 사진은 없는데.. Weiss 씨가 참여해서 그런건가..

    Reference: Clay, M.R., et al., MDM2 Amplification in Problematic Lipomatous Tumors: Analysis of FISH Testing Criteria. Am J Surg Pathol, 2015.