GSEA 에서 CLS 파일 만들기

paste(c(rep(“High”, 104), rep(“Low”, 104)), collapse = ” “)

GSEA 분석에서는 유전자 발현과 관련된 파일 1개와 표현형에 관한 파일 1개가 필요하다. 후자는 CLS 라는 확장자를 사용하도록 되어 있고, 그 구성 방식에 대해서는 홈페이지에서 찾을 수 있다. CLS 파일 포맷 중 3번째 파일은 표현형에 관하여 1개의 구절로 표시하도록 되어 있고, R에서는 paste(, collapse = ” “)를 사용해서 할 수 있다.