Category: Study

기록을 위해서 링크를 남겨둠.

https://patorjk.com/software/taag/#p=display&f=Graffiti&t=Type%20Something%20

https://www.ascii-art-generator.org/

Deep learning-enabled assessment of cardiac allograft rejection from endomyocardial biopsies – Nature Medicine

Deep learning applied to endomyocardial biopsy images, developed using datasets from three different countries, can detect rejection of transplanted hearts and determine the subtype and grade of rejection, with potential for reducing the interobserver variability inherent in manual interpretation of…

논문을 볼 수 없어서 아쉬움이 많다. 씁..

그간의 여러 논문들을 보면 이미지를 기반으로 진단하는 것은 이제는 더 이상 놀랍지 않다. 그래서 이 논문의 내용이 매우 새롭다고 할 수는 없을 것 같다.

이 논문 대표 이미지 가장 우측 하단에 보면 생검된 이미지에 대한 heatmap이 있다. 꽤 큰 조직으로 판단되고, 이렇게 큰 조직을 채취할 수 있는게 좀 부럽다.

AI 사람보다 낫다는 것을 말하고 싶은 것은 아니다. 이런 훈련 시스템이 있다는 것이 부럽다. 신경외과 수술을 의대생을 상대로 실험해 보았는데, 실제 신경외과 수술은 최소한 그보다는 더 수련받은 사람이 한다는 것은 고려되지 않았다. 제대로 연구 설계를 해보고 싶었다면 의대생이 아니라 1년차 레지던트에게 했어야 한다고 본다. 그러면 또 다른 결과가 나왔을지도 모르지만 말이다.

Cut the tyranny of copy-and-paste with these coding tools

‘Executable manuscripts’ insert results directly into documents, eliminating common mistakes.

논문을 쓰다 보면 빡치게 만드는 일이 몇 가지가 있다.

여러 사람이 작업하는 과정에서 발생하는 버젼 관리가 대표적일 것이다. 정말로 동시에 작업한다면 구글 독스와 같은 방법으로 해결할 수도 있고, 순차적이라면 일일이 파일명을 새로 지정하는 것으로 해결할 수 있다. 하지만, 논문에 엔드노트 같이 인용 논문 관리를 해야한다면 또 한 단계 난이도가 상승한다. github 와 같은 것을 제시하고 있는데, 실제로 이용하기는 조금 어렵기도 하다.

또 다른 문제라면 자료가 바뀜에 따라서 본문의 숫자를 수정해야 하는 부분이다. 이 기사에서는 R 마크다운을 설명하고 있다. 실제로 써보면 이 부분에 있어서 매우 강력한 도구이다. 자료 변경에 맞추어 매우 편하게 관련 숫자를 다 변경할 수 있다. discussion 부분까지 변경하려고 하면 그에 걸맞는 코딩을 해야하겠지만 result 부분 정도라면 무난하게 해결할 수 있다.

논문 투고 과정에 있어 각종 양식들이 좀 더 단순화되고 좀 더 일관적으로 바뀌게 된다면 좀 더 널리 이용할 수 있는 방법이 생기지 않을까 싶다.