IF 나 FISH 를 찍기엔 너무나도 아까운.. 하지만 쓰는 사람이 거의 없어 그렇게만 쓰고 있는 Confocal microscopy.
10년쯤 된 의과대학 병리과 명의의 IF & FISH 현미경보다는 비교적 새 것으로 5년쯤.. 되었다. 물론 내가 알기로는 이 녀석도 의과대학 병리과 명의로 되어 있다.
여러 사람의 도움으로 IF로 고화질로 사진을 저장하는데 성공할 수 있었다. 2048 x 2048 로 촬영하면 12MB 정도의 파일이 만들어진다. 논문이나 발표용으로 쓰기에 충분한 화질인셈이다. 🙂
임상시험을 선도하는 병원이라고 주장하면서 FISH 용 현미경 하나 사주지 않는 병원이라뉘.. 쳇!!
Reference: Matthias Bechtel JF, Noack F, Sayk F, Erasmi AW, Bartels C, Sievers HH. Histopathological grading of ascending aortic aneurysm: comparison of patients with bicuspid versus tricuspid aortic valve. J Heart Valve Dis. 2003;12(1):54-9; discussion 9-61.
이거는 2010년 WHO 개정되면서 사라져버린(?), 그래서 과거의 책을 찾아보지 않으면 알 수 없게되어버린 Wootherspoon 씨가 제안한 grade.
모르고 있던 내용인데 이렇게 치료 후 반응을 평가할 수 있는 grade 도 있다.
Reference: Burke JS. Lymphoproliferative disorders of the gastrointestinal tract: a review and pragmatic guide to diagnosis. Archives of pathology & laboratory medicine. 2011;135(10):1283-97.
어떤 물질의 분리를 위하여 전기 영동을 할 때에 그 물질의 추정치를 알기 위하여 보통은 참고치를 가지고 있는 물질과 같이 검사를 하게 된다. 이 때 추정치를 구하는 공식에는 여러 가지가 있고, 그 중에 흔하게 사용되는 방법은 Local Southern sizing algorithm 이라….고 한다.[footnote]Southern EM. Measurement of DNA length by gel electrophoresis. Anal Biochem. 1979;100(2):319-23.[/footnote]
기본 공식은 다음과 같다.
m 은 추정치, 그리고 L은 이동 거리를 나타내는데, 미지수가 3개 있으니까 이 값들을 찾기 위해서는 3개의 식이 필요하게 된다. (x, y)가 익숙하니깐 각각을 다음과 같이 표시할 수 있다.
삼원일차방정식의 해를 구하면 되는거다. c 가 공통의 값을 가지니깐 1번에서 2번을 빼고, 2번에서 3번을 빼면 다음과 같이 정리가 가능하다.
초등학교 때라면 단순하게 여기에서 곱하고, 나누고, 빼고, 더하고를 30분쯤 반복해서
정리하였을 것이다. 하지만, 고등학교 때 배우는 행렬(matrix)을 이용하면 조금은 간단하게 접근할 수 있고, R 에서도
matrix 를 지원하기 때문에 간단하게 구할 수 있다.
이렇게 간단하게 정리가 되고, R 에서는 solve 함수를 이용하면 구할 수 있다. c 는 알고 있는 (x, y) 를 대입해서 구하면 된다.